1946年「臺灣省立臺南工業專科學校」改制為「臺灣省立工學院」,成立台灣省立工學院土木系(水利組為本系前身)
1955年 成立「水利工程學系」
1956年「臺灣省立工學院」改制為「臺灣省立成功大學」
1971年「臺灣省立成功大學」改制為「國立成功大學」
1972年 成立水利工程研究所碩士班
1975年 成立大學夜間部
1984年 改名為水利及海洋工程學系
1985年 成立水利及海洋工程研究所博士班
1997年 大學夜間部更名為進修學士班
2000年 成立碩士在職進修專班
2006年 進修學士班停止招生
2006年 成立海洋科技與事務研究所
2011年 海洋科技與事務研究所併入水利及海洋工程學系
2013年 設立自然災害減災及管理國際碩士學位學程
